（１）特定家畜伝染病セーフティネット事業
口蹄疫・高病原性鳥インフルエンザ発生に伴う移動制限による家畜及び生産物の補償を行う。
（２）家畜伝染病迅速防疫体制整備事業
口蹄疫・高病原性鳥インフルエンザ発生農家の処分家畜の焼却埋却を実施する。
（３）防疫対応整備費事業
○口蹄疫や高病原性鳥インフルエンザの発生に備えた防疫資材の備蓄、防疫演習の実施、職員の教育訓練を実施する。
○口蹄疫が常在している東アジアから口蹄疫の侵入を防止する目的で国際定期便旅行者への靴底消毒業務委託（境港、鳥取港）並びに美保飛行場での靴底消毒用設備の管理委託を行う。