衛生環境研究分野における科学的・技術的中核機関として、また県民の安全確保と環境の保全・再生・活用に資する試験研究機関としての機能を発揮するため、衛生環境研究所の適切な管理運営を行う。
あわせて、ISO17025の取組を継続して実施し、試験検査の信頼性確保と精度の向上を図るとともに、県内民間検査機関等の試験検査の向上のための支援を行う。
＜衛生環境研究所のミッション＞
（１）危機管理対応として県民の安全確保に資する調査研究の実施
（２）環境の保全・再生と活用に資する研究・調査の実施
（３）住民・NPO等の環境学習、環境活動の支援
（４）試験検査の信頼性確保と精度の向上